（一）办公室（党委办公室）
主要职能：负责综合行政管理和协调工作，包括组织制定、贯彻落实各种管理制度，负责人事劳资、党务、纪检、宣传、督查督办、文件管理、人员教育与培训、后勤保障与安全保卫、离退休人员管理、工会工作、政府采购及固定资产登记管理等。
（二）总编室（中国气象局史鉴办公室）
主要职能：负责编辑出版业务管理、总体营销和协调，包括编制出版计划并组织制定、贯彻落实各种业务管理制度、版权及其法律问题、图书宣传、出版质量管理、对外业务合作等工作。中国气象局史鉴办公室受中国气象局办公室委托，负责气象部门史、志、鉴类工作的指导和协调，以及气象史志类图书编撰业务的指导。
（三）资产管理部
主要职能：负责全社资产、财务管理和图书储运工作。承担与上述工作相关的对内对外工作；承担资金、资本运营管理；项目资金监管；成本利润核算；预决算及财务报表和分析；日常财务收支等工作；承担全社的库存及在售图书的财务管理和库房管理。
（四）第一编辑室
主要职能：以天气气候为核心，负责相关选题的策划、编辑和复审等工作。
（五）第二编辑室
主要职能：以环境与减灾安全为核心，负责相关选题的策划、编辑和复审等工作。
（六）第三编辑室
主要职能：以气象服务为核心，负责相关选题的策划、编辑和复审等工作。
（七）第四编辑室
主要职能：以宣传科普文化为核心，负责相关选题的策划、编辑和复审等工作。
（八）数字出版中心（第五编辑室）
主要职能：以数字出版和社科图书为核心，负责相关选题的策划、编辑和复审等工作，承担产业项目的建设、数字资源建设和全社信息网络及新媒体运维工作；负责数字和多媒体融合产品的开发和营销。
（九）出版部
主要职能：出版部负责本版图书印制和校对等组织工作，包括印前、印后相关工作；负责生产材料的采购、调度和年度预决算的编制工作；负责图书印装质量的检查和管理等。
（十）发行部
主要职能：负责本版图书的批销发行工作，承担发行渠道的开拓和维护；负责具体宣传、销售、回款等工作，包括新华书店、民营书店、政府采购、社团团购等批销渠道的开拓和维护。